Journal archives for May 2019

May 05, 2019

Командный кубок России по фотофиксации растений: 1/32 финала

Дорогие друзья!

С 9 по 12 мая пройдет 1/32 финала Командного кубка России по фотофиксации дикорастущих растений на платформе iNaturalist.

РЕГЛАМЕНТ

1. Для этого 64 самых результативных региональных проекта будут разбиты на 32 пары. В пары будут объединены ближайшие по рейтингу регионы, т.е. сопоставимые по уровню активности.

Например,
1. Флора Приморского края | Primorsky Krai Flora - Флора Чувашии | Chuvash Republic Flora
2. Флора Алтайского края | Altai Krai Flora - Флора Москвы | Flora of Moscow
3. Флора Подмосковья | Moscow Oblast Flora - Флора Татарстана | Tatarstan Flora
и т.д.

Сетка 1/32 финала будет уточнена 8 мая. Для допуска к этому этапу необходимо занимать места с 1-го по 64-е по числу наблюдений в зачете региональных проектов.

2. В течение четырех дней (9, 10, 11, 12 мая 2019 г.) новые наблюдения сосудистых растений России, добавленные в iNaturalist, будут идти в зачет соревнований. Можно добавлять как свежие наблюдения, сделанные в природе, так и архивные фотографии. Очевидно, что всего за 4 дня не успеть, поэтому пользователи будут иметь возможность сосредоточиться "на полях" или "на архивах". К наблюдениям предъявляются все обычные требования. С типовыми ошибками, которых следует избегать, можно ознакомиться здесь: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal/21168-

3. В зачет идут только наблюдения, отвечающие требованиям проекта "Флора России | Flora of Russia" и, в связи с этим, попавшие в него автоматически.

4. Вечером 8 мая 2019 г. для всех региональных проектов мы зафиксируем статистику проекта "Флора России | Flora of Russia" как по числу наблюдений, так и по числу видов для каждого региона. То же самое мы сделаем рано утром 13 мая.

5. Победителем в паре будет признана команда, которая опередит оппонента как по числу новых наблюдений, так и по числу новых видов. При победе только в одной категории (или по числу новых видов, или по числу новых наблюдений) победителем будет признан регион, у которого на утро 13 мая 2019 г. общее число наблюдателей будет ниже.

6. Если в паре каких-либо регионов у региона-победителя будет добавлено менее 10 наблюдений, то его место занимает проигравший регион с топ-рейтингом.

Например, если в паре "Флора Марий Эл | Mari El Flora - Флора Вологодской области | Vologda Oblast Flora" победитель в зачете будет иметь всего 8 наблюдений, то его место займет проигравший в одной из топ-пар с максимальным числом новых наблюдений.

7. В 1/16 финала пары регионов-победителей будут распределены по уровню активности в 1/32 финала: в пары будут объединены ближайшие регионы по числу добавленных наблюдений за период с 9 по 12 мая 2019 г.

Свои вопросы задавайте в комментариях тут: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal/24583-1-32. Постарайтесь максимально широко оповестить участников iNaturalist из своих регионов!

Posted on May 05, 2019 15:53 by apseregin apseregin | 0 comments | Leave a comment

May 06, 2019

"Флора Севастополя" теперь отдельный проект

Дорогие друзья!

Мы приняли решение разделить крымский проект на два - "Флора Крыма" и "Флора Севастополя" (https://www.inaturalist.org/projects/sevastopol-flora).

Статистика проектов после разделения:

Крым
1,102 Observations - 470 Species - 140 Identifiers - 78 Observers

Севастополь
787 Observations - 278 Species - 115 Identifiers - 40 Observers

Надеемся на активное участие обоих проектов в 1/32 финала Кубка России по фотофиксации растений и ждем победителей в 1/16 финала!

Posted on May 06, 2019 11:12 by apseregin apseregin | 2 comments | Leave a comment

May 16, 2019

Командный кубок России по фотофиксации растений: 1/16 финала (18-20 мая)

Дорогие друзья!

С 18 по 20 мая пройдет 1/16 финала Командного кубка России по фотофиксации дикорастущих растений на платформе iNaturalist. Внимательно читайте регламент, в нем есть небольшие изменения и уточнения по сравнению с предыдущим кругом соревнований. Важнейшие отличия: проведение соревнований в течение трех дней (два выходных и один рабочий) и минимальная планка в 50 добавленных наблюдений для прохода в 1/8 финала.

РЕГЛАМЕНТ

1. По итогам предыдущего круга соревнований 32 региональных проекта разбиты на 16 пар. В пары объединены регионы, сопоставимые по уровню активности в период проведения 1/32 финала. Сетка соревнований выглядит следующим образом:

1. Флора Брянской области | Bryansk Oblast Flora - Флора Подмосковья | Moscow Oblast Flora
2. Флора Чувашии | Chuvash Republic Flora - Флора Калининградской области | Kaliningrad Oblast Flora
3. Флора Москвы | Flora of Moscow - Флора Алтайского края | Altai Krai Flora
4. Флора Ярославской области | Yaroslavl Oblast Flora - Флора Приморского края | Primorsky Krai Flora
5. Флора Камчатки | Kamchatka Flora - Флора Нижегородской области | Nizhny Novgorod Oblast Flora
6. Флора Крыма | Flora of the Crimea - Флора Владимирской области | Vladimir Oblast Flora
7. Флора Новосибирской области | Novosibirsk Oblast Flora - Флора Томской области | Tomsk Oblast Flora
8. Флора Курской области | Kursk Oblast Flora - Флора Башкирии | Bashkortostan Flora
9. Флора Татарстана | Tatarstan Flora - Флора Белгородской области | Belgorod Oblast Flora
10. Флора Республики Алтай | Altai Republic Flora - Флора Калужской области | Kaluga Oblast Flora
11. Флора Дагестана | Dagestan Flora - Флора Самарской области | Samara Oblast Flora
12. Флора Тюменской области | Tyumen Oblast Flora - Флора Омской области | Omsk Oblast Flora
13. Флора Санкт-Петербурга | St Petersburg Flora - Флора Свердловской области | Sverdlovsk Oblast Flora
14. Флора Хакасии | Flora of Khakassia - Флора Тамбовской области | Tambov Oblast Flora
15. Флора Смоленской области | Smolensk Oblast Flora - Флора Кемеровской области | Kemerovo Oblast Flora
16. Флора Ульяновской области | Ulyanovsk Oblast Flora - Обладатель WILD CARD

Обладатель WILD CARD будет назван во второй половине дня 17 мая. Это место займет тот региональный проект, в который за период с 13 по 17 мая будет добавлено максимальное число наблюдений, т.е. самый активный проект из тех, что не прошли пока в 1/16 финала.

2. В течение трех дней (18, 19, 20 мая 2019 г., но начиная уже с вечера пятницы 17 мая) новые наблюдения сосудистых растений России, добавленные в iNaturalist, будут идти в зачет соревнований. Можно добавлять как свежие наблюдения, сделанные в природе, так и архивные фотографии. К наблюдениям предъявляются все обычные требования. С типовыми ошибками, которых следует избегать, можно ознакомиться здесь: https://www.inaturalist.org/projects/flora-of-russia/journal/21168-

3. В зачет идут только наблюдения, отвечающие критериям проекта "Флора России | Flora of Russia" и, в связи с этим, попавшие в него автоматически.

4. Во второй половине дня 17 мая 2019 г. для всех региональных проектов мы зафиксируем статистику проекта "Флора России | Flora of Russia" как по числу наблюдений, так и по числу видов для каждого региона. То же самое мы сделаем рано утром 21 мая.

5. Победителем в паре будет признана команда, которая опередит оппонента как по числу новых наблюдений, так и по числу новых видов. При победе только в одной категории (или по числу новых видов, или по числу новых наблюдений) победителем будет признан регион, у которого на утро 13 мая 2019 г. общее число наблюдателей будет ниже.

6. Если в паре каких-либо регионов у региона-победителя будет добавлено менее 50 наблюдений, то его место занимает проигравший регион с топ-рейтингом.

Например, если в паре "15. Флора Смоленской области | Smolensk Oblast Flora - Флора Кемеровской области | Kemerovo Oblast Flora" победитель в зачете будет иметь всего 48 наблюдений, то его место займет проигравший в одной из топ-пар с максимальным числом новых наблюдений.

7. В 1/8 финала пары регионов-победителей будут распределены по уровню активности в 1/16 финала: в пары будут объединены ближайшие регионы по числу добавленных наблюдений за период с 18 по 20 мая 2019 г.

8. Организаторы и участники соревнований - это зарегистрированные участники платформы iNaturalist, которые добровольно согласились загружать туда свои наблюдения дикорастущих растений России (наблюдатели) и определять их (эксперты). Цель соревнований: содействовать научно точному сбору пространственных данных о флористическом разнообразии России и отдельных регионов в увлекательной форме.

Свои вопросы задавайте в комментариях. Постарайтесь максимально широко оповестить участников iNaturalist из своих регионов!

Posted on May 16, 2019 07:03 by apseregin apseregin | 0 comments | Leave a comment

May 21, 2019

GBIF (Global Biodiversity Information Facility) - почему это важно?

Репост:
Наблюдения, загруженные нами в iNaturalist, также отображаются в GBIF (Global Biodiversity Information Facility) в составе вот этого массива данных: https://www.gbif.org/dataset/50c9509d-22c7-4a22-a47d-8c48425ef4a7, но не всегда и не все. Почему? Давайте разберемся.

Если оставить в стороне международный статус Крыма (минус 2 тыс.) и пятидневную задержку с экспортом данных из iNaturalist в GBIF (минус ещё 2 тыс.), то основной причиной непопадания данных является лицензирование (минус 15 тыс.).

В настройках учетной записи каждый пользователь iNaturalist предоставляет информацию о том, по какой лицензии он делится своим контентом: фотографиями, звуками (актуально для птиц) и текстовыми метаданными. По умолчанию здесь стоит лицензия CC-BY-NC (она же CC-BY 4.0 NC). Именно эта лицензия является пороговой для того, чтобы данные автоматически передавались в GBIF и становились общедоступными для мирового научного сообщества.

Именно из GBIF мы будем выкачивать данные для "Атласа флоры России" на платформе Цифрового гербария МГУ, поскольку работаем в том же формате данных и гарантированно избавлены, таким образом, от вопросов лицензирования (авторского права) и формата данных.

Некоторые пользователи умышленно меняют лицензиии на более жёсткие, т.е. так называемые "несвободные лицензии":

- Cc by sa С указанием авторства-С сохранением условий
- Cc by nd С указанием авторства-Без производных
- Cc by nc sa С указанием авторства-Некоммерческая-С сохранением условий
- Cc by nc nd С указанием авторства-Некоммерческая-Без производных

а иногда даже:

- Нет лицензии (Все права защищены)

что уж совсем бессмысленно в эпоху, когда Гугл делает глобальный бэкап всего интернета.

Такие наблюдения НИКОГДА не попадут в GBIF - всеобщую сеть всех биологических данных мира.

Именно поэтому число наблюдений сосудистых растений с территории России на 4 апреля 2019 г. в GBIF равно не 46 000, а 28 772 штук. Но и без этого Россия уже находится на 7 месте в мире по числу наблюдений растений в iNat, а могли бы уже сейчас опередить Италию и занять первое место в Евразии.

Сам iNat является сейчас шестым (!) по числу записей источником GBIF-данных по флоре сосудистых растений России, уступая следующим базам данных:

Moscow University Herbarium (MW) 548 759
A grid-based database on vascular plant distribution in Vladimir Oblast, Russia 123 054
A global database for the distributions of crop wild relatives 69 255
EURISCO, The European Genetic Resources Search Catalogue 51 497
A grid-based database on vascular plant distribution in Udomlya District of Tver Oblast, Russia 31 669

Как видите, здесь при мягкой настройке лецензий мы могли бы уже войти в пятерку.

Если вы решите поменять лицензии на "свободные" (СС0, CC-BY, CC-BY-NC), то это делается в настройках учетной записи отдельно для метаданных и отдельно для фотографий. Выбрав другую лицензию, не забудьте поставить галочку в поле "Обновить существующие наблюдения новыми вариантами лицензий" и "Обновить существующие фото новыми вариантами лицензий".

Кроме того, мы очень рекомендуем в профиле iNaturalist в соответствующем поле указать латиницей свои полные и настоящие фамилию и имя. Это даст возможность навсегда установить подлинное авторство наблюдений. Не забывайте, что для международного сообщества кириллица выглядит примерно как китайская грамота. Да и, к тому же, всегда приятно в комментариях обращаться к автору по имени-отчеству, а не странному нику ))

Posted on May 21, 2019 20:44 by katerina_kashirina katerina_kashirina | 0 comments | Leave a comment